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La emergencia sanitaria por la pandemia de COVID-19 y ha sido necesario que sea tratada con respuesta inmediatas e integradas a todas las organizaciones involucradas para lograr intercambio de datos sobre ésta y futuras pandemias globales de rápida propagación. Este estudio se enfoca en predecir la incidencia del COVID-19 en Ecuador mediante minería de datos de los registros proporcionados por instituciones públicas del estado ecuatoriano con información oficial del COVID-19 en el Ecuador. Se experimentó con modelos de regresión y memoria a largo plazo obteniendo como resultado el modelo óptimo para estimar el número de casos positivos de COVID-19. Para los modelos empleados se hizo uso del error cuadrático como métrica del rendimiento. Del análisis de los datos sobre el COVID-19 en Ecuador el modelo de regresión polinomial predijo la incidencia con un error cuadrático de 0.86. siendo los factores más efectivos la incidencia de días anteriores y el número de población de cada una de las provincias afectadas.