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Severe immune aplastic anemia is a fatal disease due to the destruction of marrow hematopoietic cells by cytotoxic lymphocytes, serving as a paradigm for marrow failure syndromes and autoimmune diseases. To better understand its pathophysiology, we apply advanced single cell methodologies, including mass cytometry, single-cell RNA, and TCR/BCR sequencing, to patient samples from a clinical trial of immunosuppression and growth factor stimulation. We observe opposing changes in the abundance of myeloid cells and T cells, with T cell clonal expansion dominated by effector memory cells. Therapy reduces and suppresses cytotoxic T cells, but new T cell clones emerge hindering robust hematopoietic recovery. Enhanced cell-cell interactions including between hematopoietic cells and immune cells, in particular evolving IFNG and IFNGR, are noted in patients and are suppressed post-therapy. Hematologic recovery occurs with increases in the progenitor rather than stem cells. Genetic predispositions linked to immune activation genes enhances cytotoxic T cell activity and crosstalk with target cells. The transcriptional phenotype of immune cells associated with severe aplastic anaemia (SAA) may change post immunotherapy. Here the authors analyse single cell transcriptomics of hematopoietic and immune cells from SAA patients and assess how these phenotypes change after treatment showing alterations in myeloid cells and TCR clonal abundance correlate with robustness of hematopoietic response.

A República da Guiné-Bissau e a República de Cabo Verde são países africanos cujas histórias se cruzaram aquando da chegada dos navegadores portugueses no século XV. Nos últimos seis séculos, crises políticas, sociais e económicas provocaram ondas de migração dos indivíduos guineenses e cabo-verdianos para Portugal, existindo atualmente e apenas na região de Lisboa cerca de 16 000 imigrantes guineenses e 34 360 imigrantes cabo-verdianos. Tendo em conta este número elevado de imigrantes e as relações históricas entre Cabo Verde, Guiné-Bissau e Portugal, este estudo teve como objetivo a caracterização genética das populações da Guiné-Bissau e de Cabo Verde a residir na região de Lisboa e a comparação destas com a população de Portugal, com recurso a 30 InDel e 20 SNP. Estes marcadores genéticos apresentam diversas vantagens que os tornam adequados para uso forense, pelo que foram também avaliados para esse fim. Este estudo incluiu amostras de sangue de 83 indivíduos de origem guineense e de 367 indivíduos de origem cabo-verdiana, que compareceram ao Serviço de Genética e Biologia Forenses da Delegação do Sul do Instituto Nacional de Medicina Legal e Ciências Forenses no âmbito de ações de investigação de parentesco biológico. O estudo dos 30 InDel foi realizado com recurso ao kit DIPplex Investigator®(QIAGEN) e dos 20 SNP segundo a metodologia descrita por Dario (2010). A caracterização genética destas populações permitiu confirmar o contributo do povo guineense na origem do nativo cabo-verdiano, porém não esclarece a influência da população portuguesa na atual constituição genética do povo cabo-verdiano. As diferenças verificadas entre estes povos permitiram a identificação de possíveis marcadores de ancestralidade. Os parâmetros forenses calculados para os 50 marcadores indicam que estes são adequados para uso forense e os resultados obtidos irão poder ser usados na construção de uma base de dados de frequências alélicas, específica para cada uma das populações estudadas.

The purpose of this study was to investigate the prevalence of human papillomavirus 6/11 and 16/18 in patients, with oral lesions clinically diagnosed as leucoplakia, attending the School of Dentistry, University of São Paulo State/UNESP, Brazil. After paraffin embedded process, in the sections staining with H&E, 30 biopsies were screened and separated on 3 groups: 10 oral lesions without dysplasia, 10 with dysplasia, and 10 with invasive squamous cell carcinoma. The lesions with dysplasia were classified in agreement with Van Der Wall's histopathological standard method. Oral lesions were investigated for the presence of human papillomavirus (HPV) by in situ hybridization with wide-spectrum, 6/11 and 16/18 biotinylated probes. HPV 16/18 was found in 20% (n = 2) of the leucoplakia with severe-degree dysplasia. The presence of HPV 16/18 in malignant lesions suggests its importance as a risk factor for oral carcinogenesis.

O objetivo deste estudo foi investigar a prevalência do papilomavírus humano 6/11 e 16/18 em pacientes, com lesões orais clínicamente diagnosticadas como leucoplasias, atendidas na Faculdade de Odontologia de Araraquara, UNESP, Brasil. Após a inclusão em parafina, os cortes corados com H&E, foram selecionadas 30 biópsias e separadas em 3 grupos: lesões sem displasia (n=10), lesões com diferentes graus de displasia (n=10) e carcinoma espinocelular invasivo(n=10). As lesões que apresentaram displasia epitelial foram classificadas de acordo com os critérios histopatológicos propostos por Van Der Waal. As lesões foram investigadas para a presença de HPV por hibridização in situ com sondas biotiniladas de amplo espectro, 6/11 e 16/18. HPV 16/18 foi detectado em 20% (n=2) das biópsias com displasia severa. A presença de HPV 16/18 em lesões malignas sugere sua importância como fator de risco na carcinogênese oral.The purpose of this study was to investigate the prevalence of human papillomavirus 6/11 and 16/18 in patients, with oral lesions clinically diagnosed as leucoplakia, attending the School of Dentistry, University of São Paulo State/UNESP, Brazil. After paraffin embedded process, in the sections staining with H&E, 30 biopsies were screened and separated on 3 groups: 10 oral lesions without dysplasia, 10 with dysplasia, and 10 with invasive squamous cell carcinoma. The lesions with dysplasia were classified in agreement with Van Der Wall's histopathological standard method. Oral lesions were investigated for the presence of human papillomavirus (HPV) by in situ hybridization with wide-spectrum, 6/11 and 16/18 biotinylated probes. HPV 16/18 was found in 20% (n=2) of the leucoplakia with severe-degree dysplasia. The presence of HPV 16/18 in malignant lesions suggests its importance as a risk factor for oral carcinogenesis.

O objetivo deste estudo foi investigar a prevalência do papilomavírus humano 6/11 e 16/18 em pacientes, com lesões orais clínicamente diagnosticadas como leucoplasias, atendidas na Faculdade de Odontologia de Araraquara, UNESP, Brasil. Após a inclusão em parafina, os cortes corados com H&E, foram selecionadas 30 biópsias e separadas em 3 grupos: lesões sem displasia (n=10), lesões com diferentes graus de displasia (n=10) e carcinoma espinocelular invasivo(n=10). As lesões que apresentaram displasia epitelial foram classificadas de acordo com os critérios histopatológicos propostos por Van Der Waal. As lesões foram investigadas para a presença de HPV por hibridização in situ com sondas biotiniladas de amplo espectro, 6/11 e 16/18. HPV 16/18 foi detectado em 20% (n=2) das biópsias com displasia severa. A presença de HPV 16/18 em lesões malignas sugere sua importância como fator de risco na carcinogênese oral. The purpose of this study was to investigate the prevalence of human papillomavirus 6/11 and 16/18 in patients, with oral lesions clinically diagnosed as leucoplakia, attending the School of Dentistry, University of São Paulo State/UNESP, Brazil. After paraffin embedded process, in the sections staining with H&E, 30 biopsies were screened and separated on 3 groups: 10 oral lesions without dysplasia, 10 with dysplasia, and 10 with invasive squamous cell carcinoma. The lesions with dysplasia were classified in agreement with Van Der Wall's histopathological standard method. Oral lesions were investigated for the presence of human papillomavirus (HPV) by in situ hybridization with wide-spectrum, 6/11 and 16/18 biotinylated probes. HPV 16/18 was found in 20% (n=2) of the leucoplakia with severe-degree dysplasia. The presence of HPV 16/18 in malignant lesions suggests its importance as a risk factor for oral carcinogenesis.

O objetivo deste estudo foi investigar a prevalência do papilomavírus humano 6/11 e 16/18 em pacientes, com lesões orais clínicamente diagnosticadas como leucoplasias, atendidas na Faculdade de Odontologia de Araraquara, UNESP, Brasil. Após a inclusão em parafina, os cortes corados com H&E, foram selecionadas 30 biópsias e separadas em 3 grupos: lesões sem displasia (n=10), lesões com diferentes graus de displasia (n=10) e carcinoma espinocelular invasivo(n=10). As lesões que apresentaram displasia epitelial foram classificadas de acordo com os critérios histopatológicos propostos por Van Der Waal. As lesões foram investigadas para a presença de HPV por hibridização in situ com sondas biotiniladas de amplo espectro, 6/11 e 16/18. HPV 16/18 foi detectado em 20% (n=2) das biópsias com displasia severa. A presença de HPV 16/18 em lesões malignas sugere sua importância como fator de risco na carcinogênese oral.