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"遗传分化"
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长白山北部西伯利亚狍局域种群间的基因流
2020
基因流是指基因从某一群体迁移至另外一个群体的所有基因迁移方式的统称。为探索长白山北部西伯利亚狍(Capreolus pygargus)局域种群间的基因流,本研究通过收集长白山北部5个西伯利亚狍局域种群279份粪便样本,使用9个微卫星位点,鉴定出215个个体,用以评估种群间遗传多样性,同时运用贝叶斯方法探讨了群体间基因流动情况。研究结果表明,5个西伯利亚狍种群遗传多样性水平(He=0.714—0.732)高于亚洲大部分西伯利亚狍种群(He=0.522—0.628)。同时5个西伯利亚狍地理种群间遗传分化程度低(FST=-0.001 1—0.018 0),群体间存在不对称基因流,且穆棱和天桥岭地区呈明显向外扩散的趋势,可初步判断为源种群。各局域种群间基因持续交流是导致种群间遗传分化低的主要原因。本研究表明长白山北部西伯利亚狍局域种群具有良好的选育和遗传潜力,是可以进行持续利用的种质资源。
Journal Article
应用单拷贝核基因标记研究我国欧洲山杨自然居群的遗传多样性
2016
[目的]对分布于我国新疆地区欧洲山杨自然居群的遗传多样性与遗传分化进行研究。[方法]对4个欧洲山杨自然居群共72个个体的6个单拷贝核基因标记(sing-copy nuclear markers)进行扩增与测序,并计算相应的遗传多样性和遗传分化参数。[结果]表明:比对后6个基因的长度在459 bp到747 bp之间,平均多态核苷酸位点个数为14,遗传多样性指数π和θw分别达到了0.004 8和0.004 4,基因多样性指数为0.73,以上结果表明欧洲山杨表现出较高的遗传多样性水平。Tajima中性检验结果均不显著,表明所用6个单拷贝核基因均符合中性进化假设。AMOVA分析表明89.72%的遗传变异存在于居群内,居群间的平均遗传分化指数Fst为0.10,居群间平均基因流(Nm)为3.235。[结论]高度异交,高碱基突变率及超长距离的基因流机制能够很好的解释我国新疆地区欧洲山杨表现出的较高的遗传多样性水平与较低水平的遗传分化。
Journal Article
无患子天然居群遗传多样性研究
2016
[目的]通过我国无患子主要分布区的居群样本,研究无患子天然居群的遗传多样性和遗传结构。[方法]采用ISSR分子标记技术,利用12条ISSR引物分析18个天然居群的265株个体样本。[结果]表明无患子遗传多样性水平较高,物种和居群水平上的多态位点百分率(PPB)分别为95.37%和57.82%,Shannon’s信息指数(I)分别为0.256 9和0.199 8,Nei’s遗传多样性指数(H)分别为0.390 9和0.298 0。AMOVA分析表明,18个居群间出现一定程度的遗传分化,且遗传变异主要发生在居群内。UPGMA聚类和Mantel检验结果表明,18个天然居群可分为2大组群,且居群间的地理距离与遗传距离之间不存在显著相关性(r=0.066 7,P=0.541 7〉0.05)。[结论]无患子以自交为主,其天然居群遗传多样性丰富,居群内的遗传多样性高于居群间。研究结果可为无患子育种策略的科学制定和种质资源的有效保护及利用提供理论依据。
Journal Article
新疆额尔齐斯河流域苦杨与欧洲黑杨遗传多样性分析
2014
应用SSR标记技术,对新疆额尔齐斯河流域河谷分布的苦杨(Populus laurifoli)和欧洲黑杨(Populus nigra)天然居群的遗传多样性和遗传分化进行了研究.结果显示:苦杨和欧洲黑杨的天然居群具有较高的遗传多样性,且苦杨明显高于欧洲黑杨.与苦杨居群相比,欧洲黑杨居群间基因流较高,居群间的遗传分化程度较小,变异主要源于居群内.苦杨和欧洲黑杨居群内的杂合度较高,各个居群的各项遗传参数都要小于物种水平.苦杨和欧洲黑杨均偏离Hardy-Weinberg平衡,表现为杂合子过量的现象.
Journal Article
中国东北林蛙(Rana dybowskii)遗传多样性与分化研究
2010
本文利用11个微卫星多态位点检测东北林蛙(Rana dybowskii)的遗传多样性和种群遗传结构。6个东北林蛙种群的75个个体分布于中国的小兴安岭和长白山地区。11个位点在所有种群中得到的等位基因数为2~10个不等,平均5.6个;平均期望杂合度(HE)为0.572,属于中度多态。基因分化系数(FST)分析表明小兴安岭和长白山地区的种群间遗传分化显著(P〈0.001),基于Nei's DA遗传距离构建的UPGMA系统树和AMOVA的结果进一步验证了结论的准确性。因此, 建议将分布于小兴安岭和长白山的东北林蛙划分为两个单独的管理单元加以保护和管理。
Journal Article
乳源木莲种源遗传多样性和遗传分化
2008
乳源木莲(Manglietia yuyuanensisLaw)属木兰科(Magnolinaceae)木莲属(Manglietia Blume)常绿大乔木,是近年来发掘推出的优良乡土速生用材和生态造林树种,自然分布于广东北部、湖南南部、江西南部、安徽南部、浙江和福建等地,生于海拔700~1200m的阔叶林中,其生长迅速,
Journal Article
黄藤遗传多样性的RAPD分析
2005
利用RAPD标记从DNA水平对收集的4个天然黄藤种群进行遗传多样性分析。15条引物扩增得到154条片段,整个种的多态性位点比率为75.97%,Nei’s指数为0.2584,Shannon信息指数为0.3888。黄藤种的遗传多样性为0.2578,种群间的Nei遗传分化系数为0.1412,各种群间的遗传变异非常小。4个种群间的遗传相似性分析结果显示:毛感乡和尖峰岭种群间的遗传相似度最高,吊罗山和坝王岭种群间的遗传相似度最低。AMOVA分析结果表明:种群间基因分化系数为0.0262,大部分遗传变异(97.38%)来源于群体内。研究结果揭示:收集的天然黄藤种群具有较高的遗传多样性,有良好的保存和利用价值,尖峰岭种群可以作为重点保护。
Journal Article
新疆地区7个少数民族遗传分化及基因流动特征
2008
目的基于9个CODIS STR位点分型数据,探寻新疆地区7个主要少数民族的遗传分化及基因流动特征。方法计算杂合度、Nei遗传分化系数、Nei遗传距离以及Wright F统计量,使用确切概率法对民族分化水平进行统计检验;通过Mega构建系统发生树,Arlequin进行分子方差分析;应用R矩阵模型分析基因流动形式。结果7个少数民族平均杂合度均大于0.7,遗传分化系数小于2%,群体分化检验显示多数位点都有显著性差异;系统发生树和分子方差分析表明7个民族分为三支;R矩阵分析结果显示维吾尔、柯尔克孜以及乌兹别克族具有较高的基因流动水平,而回族基因流动形式呈现一定隔离性。结论新疆7个少数民族属于独立民族,但分化程度一般;其进化关系上较近,存在广泛的基因交流。
Journal Article
思茅松天然群体的遗传多样性及遗传分化
采用凝胶电泳技术,检测了思茅松(Pinus kesiya var.Langbinaensis)种子胚乳的9种同工酶。通过对9种酶系统编码的16个酶位点的遗传分析,揭示了思茅松三个天然群体的遗传多样性和遗传分化情况。思茅松天然群体的遗传多样性较高,群体的多态位点比例为0.667;平均每个位点的等位基因数为2.13;期望杂合度和观察杂合度分别为0.288和0.197。群体间的遗传分化程度较低,分化系数仅为0.052,群体间的遗传距离为0.015。表5参15。
Journal Article
白皮松交配系统及其种内遗传多样性分量比的研究
应用同工酶淀粉凝胶技术分析了白皮松天然群体的交配系统,结果表明白皮松天然群体的多位点异交率为0.451~0.522,在松属中处于较低水平,这与白皮松天然群体较低的杂合度和很弱的基因流结果吻合,进一步讨论了导致白皮松异交率低的原因。白皮松群体内家系间存在明显的遗传分化,其半同胞家系分化系数为0.322,高于群体间的遗传分化水平。群体/家系/子代个体三者间的遗传多样性分量比为DAP:DAF:DIF≈1:2:4。
Journal Article