Journal Article

Characteristics of Pigeon Paramyxovirus Serotype-1 Isolates (PPMV-1) from the Russian Federation from 2001 to 2009

Kolosov, S. N., Chvala, I. A., Drygin, V. V., Manin, T. B., Miller, P. J., Yu, Q., Starov, S. K., Pchelkina, I. P., Suarez, D. L., Andriyasov, A. V.

2013

Overview

Monitoring programs for highly dangerous avian diseases in the Russian Federation from 2001 to 2009 detected 77 samples that were PCR positive for avian paramyxovirus serotype-1 (APMV-1) from sick or dead feral and domestic pigeons. Nucleotide sequences of the fusion (F) gene, including a nucleotide sequence encoding the F protein cleavage site, were determined for these isolates. All of the studied isolates possessed virulent F0 protein cleavage sites (112KRKKRF117, 112RRQKRF117, or 112KRQKRF117). Intracerebral pathogenicity index (ICPI) values determined for seven of the isolates exceeded the value of 0.7 (the range from 0.8 to 1.41). Based on partial genome sequencing and phylogenetic analysis, the isolates were assigned to two individual sublineages within class II genotype VIb. It was determined that most of these Newcastle disease virus isolates (70/77) recovered from the pigeons belonged to a relatively poorly studied sublineage VIb/2. The complete nucleotide sequence of the genome for the Pigeon/Russia/Vladimir/687/05 isolate of sublineage VIb/2 was determined. Características de los aislamientos de paramixovirus de palomas serotipo 1 (PPMV-1) de la Federación de Rusia desde el año 2001 hasta el 2009. Mediante los programas de vigilancia para las enfermedades aviares altamente peligrosas en la Federación de Rusia desde el año 2001 hasta el 2009, se detectaron 77 muestras positivas por PCR para paramixovirus aviar del serotipo 1 (APMV-1) de palomas silvestres y domésticas que estaban enfermas o muertas. Para todos los aislamientos, se determinaron las secuencias de nucleótidos del gene de fusión (F), incluyendo una secuencia de nucleótidos que codifica el sitio de disociación de la proteína F. Todos los aislamientos estudiados poseían en la proteína F0, sitios de disociación característicos de cepas virulentas (112KRKKRF117, 112RRQKRF117 o 112KRQKRF117). Se determinó el índice de patogenicidad intracerebral (ICPI) de siete aislamientos los cuales excedieron el valor de 0.7 (rango de 0.8 a 1.41). Con base en la secuenciación parcial del genoma y en el análisis filogenético, los aislamientos fueron asignados a dos sublinajes individuales dentro de la clase II genotipo VIb. Se determinó que la mayor parte de estas cepas del virus enfermedad de Newcastle (70/77) obtenidas de las palomas pertenecían a un sublinaje VIb/2 relativamente poco estudiado. Se determinó la secuencia completa de nucleótidos del genoma del aislamiento Paloma/Rusia/Vladimir/687/05 de sublinaje VIb/2.

• Publisher: American Association of Avian Pathologists
• Subject: About the cover / Animals / APMV-1 / bird diseases / classification / Columbidae / genes / Genes, Viral / genetics / Genomes / genotype / Genotypes / isolation & purification / Molecular Sequence Data / NDV / Newcastle Disease / Newcastle Disease - virology / Newcastle disease virus / Newcastle disease virus - classification / Newcastle disease virus - genetics / Newcastle disease virus - isolation & purification / Newcastle disease virus - pathogenicity / Nucleotide sequences / Orthorubulavirus / pathogenicity / Phylogenetics / Phylogeny / pigeon / Pigeons / Polymerase chain reaction / PPMV-1 / Regular s / Reverse Transcriptase Polymerase Chain Reaction / Reverse Transcriptase Polymerase Chain Reaction - veterinary / Rubulavirus / Russia / sampling / Sequence Analysis, Protein / Sequence Analysis, Protein - veterinary / Sequence Analysis, RNA / Sequence Analysis, RNA - veterinary / Sequence Homology / Sequencing / veterinary / virology / Virulence / Viruses