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"张琦"
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Regulatable C-X-C chemokine receptor type 4 in iPSC-derived NK cells improves bone marrow chemotaxis and targeting resident tumor
2025
Relapsed or refractory acute myeloid leukemia (R/R AML) characterized by aberrant myeloid cell production in the bone marrow (BM) was challenged by a lack of potent therapeutics.Human iPSC-derived nature killer cells (iNKs), as a potent cellular therapy for R/R AML, show limited BM infiltration due to low expression of the BM homing chemokine receptor (C-X-C chemokine receptor type 4, CXCR4).While engineering iPSC with high CXCR4 expression hampers its differentiation to hematopoietic stem cells, this limitation can be circumvented by regulatable CXCR4 expression at the iNK stage through genetic engineering.CXCR4-iNKs exhibit improved cytotoxicity against BM-resident tumors, and this efficacy could be further augmented by the incorporation of chimeric antigen receptor targeting AML antigens.
iPSC-derived natural killer cells (iNKs) have emerged as a promising cellular therapy, especially for the refractory or relapsed acute myeloid leukemia (R/R AML) patients, but limited research focused on the chemotaxis of iNKs. Here we demonstrate that C-X-C chemokine receptor type 4 (CXCR4) is significantly reduced in iNKs, resulting in impaired bone marrow (BM) infiltration, which cannot be rescued by constitutively expressed CXCR4 in iPSC due to CXCR4-induced differentiation failure. To address this, we developed a strategy to allow specific expression of CXCR4 during the iNK maturation stage without compromising the final iNK yield and function. The engineered iNKs exhibited enhanced BM infiltration, resulting in improved therapeutic effects in AML murine models. This, brought attention to iNK chemotaxis, provided a meaningful strategy by incorporating well-designed gene editing with stem cells for cell product development, and obtained improved effective NK cells for AML therapy.
[Display omitted]
iPSCs provide an ideal resource for generating immune cells, with well-established methodologies enabling the derivation of diverse cell types, including natural killer (NK) cells (iNKs). These iNKs have exhibited cytotoxicity against a range of cancers, including both hematologic and solid malignancies, thereby presenting a promising approach for cell-based therapies. In this study, we integrated iNK differentiation with CRISPR-based gene editing to develop cell products with enhanced antitumor functionality. This technology has currently achieved Technology Readiness Level (TRL) 5, indicating it is feasible to advance to clinical trials.
Specifically, the expression of CXCR4 was challenged by its effect on hematopoietic stem cell (HSC) differentiation, which resulted in limited infiltration of final iNKs into bone marrow. Through precise genetic engineering techniques, we established a regulatable gene expression system to mitigate potential adverse effects during the differentiation process. This study underscores the importance of in vivo distribution and chemotaxis profiling in the development of cell-based product, highlighting the need for the optimization of manufacturing processes.
In this study, He et al. developed an optimized method that combines iPSC differentiation, chemotaxis regulation, and genetic engineering to produce a potential iPSC-derived nature killer cells product with enhanced therapeutic efficacy against bone marrow-resident tumors, such as acute myeloid leukemia and multiple myeloma.
Journal Article
基于离心圆共自配极三角形的光场相机标定
2021
TP391.4; 光场成像存在空间和角度分辨率折衷问题,导致从光场中提取角点及直线特征的精度不高,影响光场相机标定精度,为此提出了一种基于离心圆共自配极三角形的光场相机标定方法.分析了离心圆极点-极线关系,推导了离心圆共自配极三角形的性质.根据光场相机多投影中心模型对平面及二次曲面的映射,设计了一种离心圆标定板,重建了共自配极三角形并计算平面单应,实现了基于离心圆共自配极三角形的光场相机标定的线性初始化和非线性优化方法.仿真和真实数据上的实验结果表明该方法可精确标定光场相机,且稳定便捷.
Journal Article
粮食主产区耕地非粮化空间格局分异及其成因
2022
为摸清粮食主产区耕地非粮化的总体状况,揭示非粮化的空间分异特征及其成因,以徐州市为研究区域,运用空间自相关分析法、冗余分析法与案例分析法,研究粮食主产区非粮化空间分异特征、主导因素及其作用机制。研究表明:徐州市法定耕地内(LF,10.25%)、永久基本农田范围内(BF,7.30%)、两区划定范围内(FF,2.67%)非粮化率呈依次递减态势,城区非粮化率高于远郊;非粮化面积超过500 hm2的乡镇为6个,分布于远郊南部和西北角,但非粮化率则从中心向远郊递减扩散。非粮化率在FF范围内存在2个高-高集聚区,不同于LF和BF,城区周边明显高于其他区域;RDA分析显示社会经济变量解释了91.85%的非粮化面积特征向量的变化,主要驱动因子包含常住人口、农业人口、农业收入、土地流转率、农业机械总动力,其中非农业收入和农业机械劳动力分别是城区与远郊的关键驱动因子。研究表明,粮食主产区非粮化率总体不高,以菜地占用为主,但不同范围、不同区位非粮化率差异明显,必须高度重视并谨慎对待社会经济因素驱动作用。
Journal Article
梅花鹿粪便中线粒体DNAD-loop区异质性的研究
线粒体DNA(mtDNA)的异质性(heteroplasmy)是多种不同序列的mtDNA拷贝共存于一个个体的现象,对线粒体、细胞和组织的机能产生明显的影响。粪便是野生动物研究中最易得的材料,含有动物肠上皮脱落的细胞及其DNA,其中的mtDNA异质性可以反映个体在各种因素影响下肠上皮细胞DNA的稳定性,为揭示个体的适合度、生态对策等提供新的线索。梅花鹿(Cervus nippon)是森林生态系统中的关键物种,其肠上皮中mtDNA异质性的特点尚未见报道。本研究用27只6~96月龄的圈养梅花鹿粪便样本,采用PCR扩增子高通量测序技术,对mtDNA D-loop区的异质性进行定量分析。结果显示:D-loop区广泛分布着异质性位点,但相对集中于第175~368位碱基的高变区(HyperHPR),而第597~687位碱基区间则较少发生,为保守区(HypoHPR)。HyperHPR异质性突变的多样性(HDα)极显著高于HypoHPR(P < 0.001)。转换(TS)是主要碱基替换类型,其发生频率远高于颠换(TV)。HyperHPR中TS/TV平均为0.11,而HypoHPR平均为0.19,说明异质性突变在HypoHPR受到更强的选择性清除。无论是在D-loop区、HyperHPR与HypoHPR,雌雄个体之间异质性突变指标均无显著差异(D-loop区,
大熊猫粪便中线粒体基因库特点研究
为了解大熊猫(Ailuropoda melanoleuca)肠道脱落细胞中线粒体DNA(mtDNA)的异质性特点及其与年龄的关系,以92只不同年龄的大熊猫粪便为材料,通过扩增子高通量测序研究非编码的D-loop区、编码rRNA的16S rRNA区以及编码蛋白质的ND1和ND2区的异质性。结果显示:D-loop区存在3个异质性热点区段,突变碱基的数量远远高于其他3个编码区;D-loop区TS/TV小于16S rRNA和ND两个编码区,表明后两者较D-loop区受到更强烈的纯化选择;ND区第3位密码子的突变频率显著高于前两位,选择压力最低。此外,16SA3、ND1A6和ND2A7三个编码区的异质性可能与年龄相关。上述结果表明,大熊猫粪便DNA的异质性突变构成了一个多样性较高的线粒体基因库,突变在组织细胞水平上受到自然选择的作用。该线粒体基因库为揭示动物适应性进化机制、个体对环境的适应方式、个体适合度和动物与肠道微生物及环境的关系等提供一个全新的角度,也可能成为有潜力的大熊猫个体年龄预测标记。
Journal Article
基于文献计量的主要作物QTL定位研究动态分析
2018
作物数量性状遗传位点(Quantitative Trait Locus,QTL)定位研究的开展,有助于深入理解遗传基础,挖掘和克隆基因,为分子标记辅助选择育种及分子设计育种提供有力支撑。文章以Web of Science中SCI-E库为数据来源,检索12种主要作物2003年—2017年期间有关QTL定位研究论文,用文献计量方法分析论文产出的数量特征,比较不同国家和作者的研究重点,分析过去15年全球主要作物QTL定位研究动态,把握该领域发展格局,明晰优势机构、研究团队及主流刊物,揭示研究热点,识别中国国际地位,明确中国存在的问题及差距,研判研究趋势,为相关研究人员提供参考。
Journal Article
氮肥对油菜在不同土壤中吸收积累Cd的影响
2019
以三种不同程度Cd污染土壤为材料,通过盆栽试验研究NH4Cl和(NH4)2SO4两种氮肥对土壤Cd有效性及油菜吸收、转运Cd的影响,评价油菜对Cd的生物累积量,以期为油菜修复Cd污染土壤的优化施肥措施提供理论支撑。结果表明:施加NH4Cl和(NH4)2SO4均显著降低了土壤的pH,(NH4)2SO4处理土壤pH低于施加NH4Cl处理的土壤,施肥处理下生长期非根际土pH低于根际土,成熟期非根际土pH高于根际土。施加(NH4)2SO4和NH4Cl均使土壤中有效态Cd含量增加。(NH4)2SO4处理有效态Cd的浓度高于NH4Cl处理。油菜成熟期土壤中有效态Cd的浓度低于生长期,生长期和成熟期整体表现出根际土中Cd的总量高于非根际土。施加(NH4)2SO4和NH4Cl均增加油菜各部位Cd的含量,提高油菜的富集系数和转运系数,油菜从根到叶对Cd的转运系数最高。研究表明油菜作为Cd污染土壤的修复植物有一定安全保障。
Journal Article
大熊猫粪便中线粒体基因库特点研究
为了解大熊猫(Ailuropoda melanoleuca)肠道脱落细胞中线粒体DNA(mtDNA)的异质性特点及其与年龄的关系,以92只不同年龄的大熊猫粪便为材料,通过扩增子高通量测序研究非编码的D-loop区、编码rRNA的16S rRNA区以及编码蛋白质的ND1和ND2区的异质性。结果显示:D-loop区存在3个异质性热点区段,突变碱基的数量远远高于其他3个编码区;D-loop区TS/TV小于16S rRNA和ND两个编码区,表明后两者较D-loop区受到更强烈的纯化选择;ND区第3位密码子的突变频率显著高于前两位,选择压力最低。此外,16SA3、ND1A6和ND2A7三个编码区的异质性可能与年龄相关。上述结果表明,大熊猫粪便DNA的异质性突变构成了一个多样性较高的线粒体基因库,突变在组织细胞水平上受到自然选择的作用。该线粒体基因库为揭示动物适应性进化机制、个体对环境的适应方式、个体适合度和动物与肠道微生物及环境的关系等提供一个全新的角度,也可能成为有潜力的大熊猫个体年龄预测标记。
Journal Article
十一个DNA甲基化位点对野生与圈养环颈雉鉴别能力的评价
过度开发、非法猎捕和利用野生动物资源已经成为威胁生物多样性的重要因素。将野外非法获取的动物混入合法养殖动物中掩盖违法犯罪的行为层出不穷,因此需要从科学鉴定角度区分不同来源的动物。骨骼肌是非法猎捕和贸易的主要目标产品,但尚没有有效的方法鉴别其来源。本研究以被归入《国家畜禽资源目录》的新型家禽,同时又是“三有”物种的环颈雉(Phasianus colchicus)为例,采用甲基化敏感性高分辨率熔解曲线技术(methylation-sensitive high resolution melting,MS-HRM)测试了26个甲基化水平在野生和圈养环颈雉之间具有潜在差异的位点,得到11个可以稳定检测的位点。统计分析发现,LOC116232884、NFATC2、FGF9-3、FGF9-2、MAPK8、DUSP10和MYCN七个位点在两组间的甲基化水平差异达到显著或极显著水平(P = 0.000 ~ 0.004),各位点整体正确鉴别率为62.22% ~ 82.78%,累积鉴别能力可达99.999 93%。研究结果为建立鉴别野生和圈养环颈雉的方法提供了位点资源和检测方法,也为解决其他同类物种的鉴别问题提供了借鉴。
Journal Article
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