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"生物标记物"
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非小细胞肺癌患者尿蛋白质组差异表达分析
2015
背景与目的筛查非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)患者尿液中差异表达蛋白,确定可用于NSCLC早期诊断、监测预后和治疗评估的生物标记物。方法分别收集40例已病理证实初诊NSCLC患者、8例肺部良性疾病患者和22例健康志愿者的尿液样本。利用0.9%一维十二烷基硫酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳(sodium dode-cyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis,1D SDS-PAGE)技术和MS-Thermo-Orbitrap-Velos质谱分析仪对NSCLC组和非肿瘤组尿液中蛋白质进行分离、提取及识别,鉴定出NSCLC患者尿液中的差异表达蛋白。应用SPSS 20.0软件中受试者工作特征曲线(receiver operating characteristic curve,ROC)分别对其敏感性、特异性进行分析,并进行实验验证,从而确定出与NSCLC相关的生物标记物。结果 NSCLC患者组和非肿瘤组尿液差异性表达蛋白质集中表现在90 k Da、60 k Da和20 k Da-30 k Da凝胶条带中。在NSCLC患者尿液蛋白分析中发现了4种与NSCLC相关的差异表达蛋白,包括上调蛋白LRG1、CA1和下调蛋白VPS4B、YWHAZ。这4种差异表达蛋白作为独立的NSCLC生物标记物其敏感性较低:LRG1蛋白敏感性83.0%(25/30)、特异性90.0%(18/20);CA1蛋白敏感性60.0%(18/30)、特异性90.0%(18/20);VPS4B蛋白敏感性73.3%(22/30)、特异性90.0%(18/20);YWHAZ蛋白敏感性60.0%(18/30)、特异性95.0%(19/20)。而采用蛋白质组合模式对NSCLC进行筛查、诊断,则其敏感性和特异性分别可高达96.7%(29/30)和85%(17/20)。结论 LRG1、CA1蛋白在NSCLC患者尿液中高表达,而VPS4B、YWHAZ蛋白呈低表达,差异表达蛋白均提示有可能成为用于NSCLC早期筛查、监测预后和治疗评估的生物标记物。LRG1、CA1、VPS4B和YWHAZ尿液蛋白作为单一生物标记物应用于NSCLC筛查和诊断的敏感性较低,而采用蛋白质组合模式明显优于独立模式对NSCLC的筛查和诊断,故蛋白质组合模式在临床诊疗中将更具有良好应用价值和前景。
Journal Article
肺癌的个体化靶向治疗
2013
南于每一肺癌患者在临床特征、预后、治疗反应和耐受性方面的进展都是独特的,所以肺癌被认为是异质性疾病。个体化用药是指运用标志物来预测哪些患者更易获益于某种治疗。对于肺癌而言,日趋完善的表皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor,EGFR)和新发现的棘皮动物微管相关蛋白样4_l司变淋巴瘤激酶(echinoderm microtubule associated protein like 4-anap lasticlymphoma kinase,EML4-ALK)是重要的治疗靶标。本综述包括EGFR和EML4-ALK活化的机制、预测性生物标记物、耐药的机理和已有的靶向性酪氨酸激酶抑制剂。本文将通过总结基于生物标记物筛选患者而进行的前瞻性临床试验来探讨EGFR和ALK靶向治疗的疗效。此外,由于革命性的测序和系统生物学技术会为癌症的分子特征提供一个全面的理解,有助于为更适宜靶向治疗的患者提供更精确的区分从而提供更有前景的个体化治疗,本综述也将包括这些技术。同时,非亚裔人群中EGFR和ALK相对较低的突变发生率和突变患者反应的缺乏限制了靶向于EGFR或ALK的治疗的应用。测序和系统生物学策略则可能为这些患者提供新的解决方案。
Journal Article
用以监测和预测癌症疗效的分子诊断
2011
“……许多研究证实,研发分子诊断生物标记物来监测和预测各种癌症的疗效是切实有效的……未来的研究重点是促使标记物从基础研究走向临床应用。”
Journal Article
蛋白质组学与转化医学:用以癌症诊断、预后和疗效预测的分子生物标记物
2011
“生物医学研究的最新技术进展使鉴定多种分子生物标记物变得更加容易,有助于促进癌症筛查和检测……通过允许医生为患者制定个体化治疗来提高癌症治疗的有效性和安全性。”
Journal Article
钙结合蛋白S100A7在肺癌中的选择性表达
2009
背景与目的S100A7是S100蛋白家族成员,它的过表达与一些癌的发生和转移密切相关,本文旨在探讨S100A7在肺癌中的差异表达。方法采用RT-PCR、Western blot和免疫组化等技术探讨了S100A7蛋白在肺癌及其癌旁组织中的表达差异。结果S100A7只在肺鳞癌和大细胞肺癌组织中有表达,而在肺腺癌、小细胞肺癌及其他亚型的肺癌组织、癌旁组织和正常肺组织中不表达;并发现S100A7蛋白的表达在高分化的癌细胞中较强。结论S100A7蛋白可选择性地在不同亚型的肺癌中表达,很可能成为肺癌亚型诊断的标志蛋白之一。
Journal Article
miRNAs在肺癌中的作用
2009
"这些miRNAs在血清中的高表达是非小细胞肺癌的血液生物标记物……"
肺癌居全球癌症死亡原因的首位,但迄今尚无有效针对这一致命疾患的诊断和预测性生物标记物。新证据表明,miRNAs具有以细胞周期依赖性方式调节转录及翻译的潜能,这为我们在分子水平深入理解癌症开拓了新视野。
Journal Article
癌症研究进展:第100届AACR年会见闻
2009
本文将综述2009年美国癌症研究学会(AACR)第100届年会的主要报告,并讨论各项科研成果,以及它们对临床实践和在研临床试验的影响。在这些报告中,靶向治疗的预测性生物标记物的相关报道让适当患者选择合适药物变得可行。通过对体细胞基因拷贝数改变、基因组重排及序列突变进行分析,癌基因组的研究结果在深入揭示多种癌症的发病机制中显示了重要作用。有报告再次证实癌干细胞在治疗性抵抗、促血管生成和转移中起重要作用。有报告从不同角度对各种癌症类型中癌干细胞生物学的认识作了介绍。有报告对小分子RNA(microRNA)改变的最新研究成果进行了概述。除癌细胞研究外,研究人员已开始观察肿瘤细胞与其周围环境的信息交流。有报告介绍了肿瘤微环境与炎症方面的最新成果。有报告陈述了纳米技术和生物标记物发现的最新进展。此外,大会上有些临床试验结果支持应用新的靶向治疗方法,而有些研究者则致力于采用现有药物和方法进行癌症预防。本文将对2009年AACR年会的上述及其它重要报告进行讨论,旨在为读者提供全球最重要癌症研究会议上的癌症研究最新进展。
Journal Article
吉非替尼治疗前后肺腺癌患者血清蛋白质谱的变化
2009
背景与目的表皮细胞生长因子受体(epidermal growth factor receptor,EGFR)酪氨酸激酶抑制剂(tyrosine kinase inhibitor,TKI)治疗晚期NSCLC患者最终都会出现耐药。本研究目的是检测耐药前后血清蛋白质谱的变化,探索可能用于预测TKI治疗后出现耐药的血清预测因子。方法收集9例晚期NSCLC患者接受吉非替尼(gefitinib)治疗前后自身配对的血清样本20份,即入组口服吉非替尼前及临床评价为疾病进展前两周所采集的外周血血清。所有的患者对吉非替尼的最佳总疗效评价为疾病稳定或部分缓解。所有样本用弱阳离子微珠进行预分离后,在Bruker Autofle^TM基质辅助激光解析离子化.时间飞行质谱仪(MALDI-TOF-MS)上进行血清蛋白质谱检测。以ClinProTools(Version:2.1)软件进行数据采集分析。结果自身配对分析发现有7个血清蛋白质表达水平在肺癌患者耐药前后的血清中有统计学差异。该7个血清蛋白质谱峰为3242.09、8690.36、2952.64、3224.04、1450.51、1887.8及3935.73(m/z)。有3个血清蛋白(3242.09、2952.64及3224.04)在耐药血清中下调,其余4个血清蛋白(8690.36、1450.51、1887.8及3935.73)则出现上调。结论特定的血清差异蛋白可能与吉非替尼治疗有效患者在治疗过程中出现耐药相关。这些差异蛋白的特性及其与吉非替尼治疗耐药的分子机制有待进一步研究。
Journal Article
Metabonomic Study with a High Performance Liquid Chromatography Coupling to a Triple Quadruple Mass Spectrometer to Identify Biomarkers from Urine of High-fat Fed and Streptozotocin Treated Rats
by
陳紀樺(Chen, Chi-hua)
,
程竹青(Chen, Chu-chin)
,
林俊仁(Lin, Chun-jen)
in
Biomarkers
,
High performance liquid chromatography
,
Mass Spectrometry
2009
Journal Article
Double-stranded DNA in exosomes: a novel biomarker in cancer detection
by
Basant Kumar Thakur Haiying Zhang Annette Becker Irina Matei Yujie Huang Bruno Costa-Silva Yan Zheng Ayuko Hoshino Helene Brazier Jenny Xiang Caitlin Williams Ruth Rodriguez-Barrueco Jose M Silva Weijia Zhang Stephen Hearn Olivier Elemento Navid Paknejad Katia Manova-Todorova Karl Welte Jacqueline Bromberg Hector Peinado David Lyden
in
631/337
,
631/67/1857
,
Animals
2014
Exosomes, small membrane vesicles (30-100 nm) of endocytic origin secreted by most cell types, contain functional biomolecules, which can be horizontally transferred to recipient cells [1]. Exosomes bear a specific protein and lipid composition, and carry a select set of functional mRNAs and microRNAs [2]. Recently, our group has shown that c-Met shed in exosomes can promote a proangiogenic and prometastatic phenotype in bone marrow-derived progenitor cells during melanoma progression [3]. In previous research, retrotransposon RNA transcripts, single-stranded DNA (ssDNA),
Journal Article