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"线粒体DNA"
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中国福建发现布角蟾属一新种(两栖纲:角蟾科)
2024年9月在福建省梅花山国家级自然保护区采集到布角蟾属(Boulenophrys)物种3号标本,经形态特征比较及基于72个物种的2个线粒体片段(16S rRNA和COI)联合建树,支持采集到的布角蟾标本为新种——梅花山角蟾(Boulenophrys meihuamontis Luo and Huang sp. nov.)。正模标本:MHSLX18-2,雄性成体,2024年9月14日福建省龙岩市上杭县梅花山国家级自然保护区(25°16′19.33″ N,116°50′20.32″ E;海拔1 059 m);副模标本:MHSLX18-1和MHSLX18-3,雄性成体,采集信息与正模标本相同。正模和副模标本均保存于福建农林大学林学院标本馆(FJFC)。新物种可通过以下形态特征组合和所有已知同属物种区分:1)成体体型小,雄性体长26.9~28.3 mm(n = 3);2)头扁平,头长小于头宽;3)舌后端无缺刻;4)无犁骨齿及犁骨棱;5)背面皮肤较粗糙,有稀疏的小疣粒,四肢表面及外侧均具明显锯齿状肤棱;6)后肢贴体前伸胫跗关节均达眼后角;7)左右跟部不相遇;8)趾扁平,趾侧无缘膜并具蹼迹;9)雄性第Ⅰ指与第Ⅱ指基部具婚刺。
Journal Article
国境口岸截获象牙地理溯源分析初探
国境口岸截获象牙的地理溯源是识别非法象牙来源地,确定走私热点地区,描绘走私通道,有针对性地打击象牙非法贸易的重要前提。利用线粒体DNA单倍型溯源的方法,对我国的126份国境口岸截获象牙样本进行地理溯源。从126份样本中共得出22个地理单倍型,为2个支系和7个进化枝。通过Loxodonta Localizer 数据库比对分析,109份样本确定了地理来源,进而推断出3个来源地:中非刚果盆地的Tridom跨境生态保护区,东非的肯尼亚、坦桑尼亚和乌干达等国及非洲南部的KAZA跨境保护区。这3块地区也是目前国际公认的象牙盗猎最为严重的热点地区。将溯源结果与跨国犯罪组织的象牙偷猎、贩运和走私网络结合分析,将为海关缉私部门打击国际象牙走私链条提供有效的信息和关注重点。
Journal Article
基于线粒体DNA Cyt b西伯利亚狍种群分子系统地理学研究
2020
世界上对西伯利亚狍的分类和系统地理格局划分意见不一,目前普遍认为将西伯利亚狍分为Capreolus pygargus pygargus、Capreolus pygargus tianschanicus、Capreolus pygargus melanotis 3个亚种。本研究对中国小兴安岭地区的西伯利亚狍(40份样品)的线粒体DNA Cyt b部分序列进行分析,共扩增出32条序列,获得9个单倍型。并利用从GenBank下载的来自世界各地的40条西伯利亚狍的线粒体DNA Cyt b序列分析西伯利亚狍的系统地理状况。系统发育和单倍型网络分析结果表明,西伯利亚狍由4个单倍群组成:A由俄罗斯远东地区(Khabarovsk、Yakutia)和韩国济州岛的单倍型组成。B由哈萨克斯坦、俄罗斯西伯利亚地区(Sverdlovsk、Irkutsk)和波兰等地区的单倍型组成。C由中国东北地区的单倍型组成。D由蒙古地区的单倍型组成。本文研究结果与西伯利亚狍亚种分类相吻合,且认为西伯利亚狍具有清晰的系统发育关系和地理模式,此外,根据研究成果对西伯利亚狍的保护和管理提出了建议。
Journal Article
西藏自治区当雄县羊八井镇高山倭蛙的种下外观多态性
2025
Q954.3; 自然界中的许多动物,尤其是两栖类,为了避免被捕食和提高生存概率,演化出了多种多样的颜色和/或图案.为了更深入地了解高山倭蛙(Nanorana parkeri)的体色和外观多样性,在西藏自治区当雄县羊八井镇一静水湿地中(29°58′53″ N,90° 22′21″ E;海拔4 384 m)采集了345只成体高山倭蛙.根据3个可清晰辨别的特征:背底色(黄色和灰色),背中线(缺失、宽或窄),背部黑斑(存在、缺失和极少),可识别出此区域的高山倭蛙存在8种色斑形态.灰色个体比黄色个体更常见(频率分别为57.98%和42.02%);背中线存在的个体比背中线缺失的个体数量更多(频率分别为78.26%和21.74%),其中具窄背中线的个体比具宽背中线个体的数量更多(频率分别为62.32%和15.94%);存在背部黑斑的个体数量远多于背部黑斑缺失的个体数量(频率分别为82.61%和17.39%).在未来,还需进一步了解不同分布区域高山倭蛙的多态性状况以及引起多态性的分子机制,以期为探究其他两栖类物种多态性的分子机制提供参考.
Journal Article
蓝狐母系起源及谱系重建
2021
蓝狐是圈养北极狐(Vulpex lagopus)的主要品种。因缺少科学有效的遗传管理,引进种兽后代逐年退化,造成反复引种的依赖性局面。为保持蓝狐种群的优良性状,开展科学选种选育、降低近交的概率,分析122只引进芬兰蓝狐的线粒体DNA DLoop区294 bp序列,结合已发表的野生、圈养北极狐种群单倍型数据进行母系追踪,应用11个微卫星位点的复合扩增对其中53只进行单亲亲权鉴定。结果表明:蓝狐种群仅有1种单倍型,血统单一,与瑞典养殖种群、西伯利亚野生种群关系密切。11个微卫星位点累计排除概率达到09999,成功为11只仔狐找到生物学父亲。同时发现,母狐经2次输精后成功受孕的概率较高(64%),以及同窝仔狐中存在多重父权的现象。因此,线粒体和微卫星等分子手段的引入,可以为蓝狐的遗传管理提供科学有效的依据。
Journal Article
海南鳽贵州雷公山小种群遗传多样性分析
2022
为了解贵州省内海南鳽(Gorsachius magnificus)雷公山小种群的遗传多样性,通过分析海南鳽、黑冠鳽(G.melanolophus)和栗头鳽(G.goisagi)3种鸟类线粒体全基因组序列变异位点差异,筛选出NADH6-tRNAGlu-D-loop序列作为海南鳽和夜鳽属物种鉴定的最优分子标记,对贵州省野生动物救护中心获得不明原因死亡的5只海南鳽进行扩增,并对所获序列进行碱基组成、遗传多样性、中性检验、错配分布和单倍型网络分析。结果表明:海南鳽有一定的A+T偏倚,转换小于颠换,单倍型多样性高,核苷酸多样性低。Tajima’s D值为-0.073 39(P>0.10),Fu’s Fs值为0.051(P>0.10),错配分布曲线呈多峰,单倍型较分散,无祖先单倍型,表明海南鳽雷公山小种群经历过瓶颈效应,目前可能正处于扩张状态。研究结果可为海南鳽和夜鳽属物种的系统分类与保护提供理论依据。
Journal Article
丹顶鹤的保护遗传学与保护基因组学研究
丹顶鹤(Grus japonensis)是一种大型濒危鸟类,现存数量不足4 000只,分成两个地理隔离的野生种群——大陆种群(2 000只)和岛屿种群(1 900只),生活于亚洲东北部。两个种群的遗传结构没有显著分化,但大陆种群比岛屿种群的遗传多样性更高。中国是大陆种群的主要栖息地,目前保护工作依然任务艰巨,对大陆种群遗传多样性的深入认识和保护迫在眉睫。本文回顾了过去40年对丹顶鹤实施全面保护以来,在丹顶鹤与其他鹤类的系统演化关系、丹顶鹤岛屿和大陆种群遗传多样性、亲子鉴定与亲族区域地理分布、线粒体基因组及全基因组等方面的研究进展,探讨了目前迫切需要解决的大陆种群内部遗传分化与交流、人工繁殖种群遗传谱系与基因信息库的建设等问题,以及新的基因组学技术在今后丹顶鹤保护中的潜在作用。
Journal Article
上海动物园非洲企鹅种群线粒体DNA序列分析及遗传管理建议
2015
非洲企鹅(Spheniscus demersus)是一种濒危海鸟,也是动物园展出的重要物种。上海动物园从日本和荷兰引进非洲企鹅,种群不断扩大,并成为国内种群发展的基础。但对其遗传多样性和结构了解很少,无法开展有效的遗传管理。本研究分析了上海动物园39只非洲企鹅的mtDNA D-loop区430 bp序列,并与已发表的日本种群的数据进行比较。结果表明,该片段存在15个变异位点,占分析位点的3.5%; 共定义了10个单倍型,其遗传距离为0.002~0.019。日本种群包含A、B两个mtDNA D-loop单倍型世系,上海种群的10个单倍型均属于A世系,且与日本种群有5个共享单倍型,其遗传多样性水平略低于日本种群。上海种群可以进一步分为3个小的世系,但置信度偏低(54%~87%)。上述结果提示,上海种群相对于日本种群的A世系而言有较好涵盖度,但仍有必要进一步引进建群个体,尤其是含有B世系单倍型的个体。
Journal Article
原发性非小细胞肺癌中线粒体DNA含量变化的研究
背景与目的已有的研究表明:线粒体DNA(mitochondrial DNA,mtDNA)突变和拷贝数的改变和肿瘤有着密切联系;大多数实体性肿瘤中mtDNA拷贝数有明显降低。本研究旨在探讨线粒体基因组含量的改变和原发性非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)的关系。方法通过实时荧光定量PCR,对肺癌及相对应的癌旁肺组织mtDNA的含量进行精确定量(拷贝数/细胞)。结果肺癌组织mtDNA的平均拷贝数/细胞为395±125,而相对应的正常肺组织为733±196,前者明显低于后者(P〈0.001)。肺癌mtDNA含量的改变与患者性别、年龄、是否吸烟及肿瘤的病理类型无关(P〉0.05)。结论 mtDNA含量的改变与NSCLC的发生发展密切相关,同时也可能影响其治疗和预后。
Journal Article
Huangshan population of Chinese Zacco platypus (Teleostei, Cyprinidae) harbors diverse matrilines and high genetic diversity
by
Xin ZHENG Tian-Qi ZHOU Tao WAN Anabel PERDICES Jin-Quan YANG Xin-Sheng TANG Zheng-Ping WANG Li-Qun HUANG Song HUANG Shun-Ping HE
in
中国东部
,
线粒体DNA
,
遗传多样性
2016
Six main mitochondrial DNA (mtDNA) lineages have been described in minnow (Zacco platypus) samples obtained from northern, western and southern China Perdices et al. (2004) predicted that further sampling of other tributaries might discover more lineages of this species. In this study, we collected 26 Zacco platypus individuals in the Huangshan area of eastern China and determined the cytochrome b (cytb) sequence variations. Combined with reported data in GenBank, we identified ten matrilines (Zacco A-J) in a total of 169 samples, with relatively high molecular divergence found among them. The Huangshan population had the greatest genetic variation among all sampled regions and hosted six of the ten matrilines. Our results highlight the significance of the Huangshan area for the conservation of Zacco platypus.
Journal Article