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目的：分析大鼠软骨形成过程中小分子 RNA（sRNA）表达谱变化及其基因功能,探讨软骨细胞增殖与分化的机制。方法取新生、断乳、性成熟3个时间节点的雌性 SD 大鼠股骨头软骨构建 sRNA 文库,Solexa 测序平台鉴定软骨组织全部 sRNA 序列表达,所得的全部清洁序列与 SD 大鼠基因组信息比对,并做生物信息学分析。结果3个文库筛选出与基因组序列完全匹配序列,分别对应着217921条（41.23%）、196650条（38.74%）、245436条（41.54%）unique sRNA 序列。长度为20~24 nt 的 sRNA 占比：d 0为71.94%、d 21为72.85%、d 42为86.39%；其中,长度为22 nt的 sRNA 约占清洁序列的一半。文库序列分布特征,符合高质量 sRNA 文库的特征。超过总数62%的清洁序列来自于成熟 miRNA 序列,但在3个文库中的占比却仅仅只有0.69%、0.78%和0.63%。约60%的unique sRNA 序列无法与 miRBase 20.0和 Rfam9.1匹配。结论3个 sRNA 文库的 miRNA 这种分布模式,可能暗示着有功能不同或者来源各异的 miRNA,参与了对骨骼发育和骨形成关键阶段软骨细胞增殖与分化的调控。

泛素结合酶（E2）是泛素／26S蛋白酶体途径中3个关键酶之一，在靶蛋白识别、与泛素连接酶（E3）互作等蛋白的泛素依赖性水解和N-末端规则依赖性水解途径的关键环节中起重要作用。采用Sdexa测序技术获得了1条普通油茶E2的全长cDNA序列，命名为UBE2一J2，该基因编码239AA，与其它物种的E2具有较高的一致性和相似性；同源建模的结果表明：普通油茶UBE2-J2蛋白具有泛素结合酶催化位点（UBCc），第8～122位氨基酸碱基为其泛素结合酶基因家族的保守区域，第75～122位氨基酸残基区域中有17个可与泛素形成硫酯键中间产物的残基，其中，87位的半胱氨酸残基是该酶活性中心位点，另有5个残基是与E3酶相互作用的位点。UBE2．J2具有C端延伸结构，故普通油茶UBE2-J2蛋白属于II类E2基因家族成员。